温室用来对培养的再生植株的驯化和移栽，是组培苗成功下地的保障。温室可以是简易的单坡或双坡塑料大棚，也可以是钢架、玻璃或塑料采光板建造的多功能温室，温室的功能越好，驯化移栽的成功率越有保障。以智能温室而言，配备了由计算机控制的可移动天窗、遮阳系统、保温、湿窗帘/风扇降温系统、喷滴灌系统或滴灌系统、移动苗床等自动化设施，其内可对温度、湿度、光照进行非常好的控制，以满足组培苗的驯化和生长。
温室要求配备育苗盘、营养钵、营养袋、培养槽、花盆等培养装置，及蛭石、草炭、花风岩、珍珠岩、椰糠、沙、土等基质，及有机或无机肥料等。另外还要配备有遮阳（或阴）网、防虫网、自来水、喷灌、喷壶等洒水装置。